Java - Leer y Escribir Binario

Hola buenas soy nuevo en el foro y como quien dice programando tambien llevo toda la tarde mirando la lectura y escritura de archivos y el tema de binario no lo llego a entender del todo era por si me podeis ayudar de alguna manera por favor lo agradeceria mucho el tema de lectura y escritura en modo texto si lo llego a entender perfectamente

quieres entender binario, o sea en base dos, o quieres generar binarios

0=0000 0000
1=0000 0001
2=0000 0010
3=0000 0011
.
.
.
128=1000 0000
.
.
.
256=0001 0000 0000

a=0110 0001
b=0110 0010

etc

estos valores son en binario, pero hay que pasar con el hexadecimal
un numero no empacado a binario es
1=f1=1111 0001
a=61
.
.
.
etc

La pregunta tiene que ver con lectura y escritura de archivos (modo texto / modo binario) segun entiendo, no escribir numeros en binario.