Java - Recorrido de directorios en java

Hola, muy buenas! estoy haciendo un programa en java y necesito que me haga un recorrido por los directorios y subdirectorios de todas las unidades del discoduro y para ello quiero (o eso intento) usar la clase File para crearme una instancia y trabajar sobre sus métodos, mediante el método .listRoots(), puedo sacar un array de File en donde están las unidades del PC, pero necesito que de cada uno de ellos, me saque un listado de Directorios, preferiblemente también en un array de File, espero haberme explicado com claridad, si hay alguna duda, no lo duden díganmelo. GRACIAS por su atención.

Una vez que obtienes los padres via listRoots, puedes usar listFiles para obtener un arreglo con los archivos que tiene cada root. Puedes usar isDirectory() para ver cual es un subdirectorio y cual es un archivo.
Si vas a mostrar todos los subdirectorios recorriendo la jerarquia de directorios es mas facil hacer una rutina recursiva