Java - Problema generación pdf's con fop y websphere

Hola,
tengo un problema bastante gordo con la generación de pdf's en una aplicación web. Utilizo las librerías fop de Apache para pasar un documento xml de word a pdf y después de que se generen unos cuantos correctamente, empiezan a salir los pdf's en blanco. El servidor de aplicaciones es un websphe.
Tienen alguna idea pq podría ser?

saludos