Java - logs 117 megas

Buenas tardes, tengo una duda y desearia escuchar opiniones, recorro un log. de 117 mb el cual macheo con unas reg. exp, esta tardando entre 3 y cuatro horas! esto es normal? puede ser por el casteo que que se le hace al string cuando recorro el log para sacarle caracteres no necesarios?
cualquier opinion que mejore la performance es bien agradecida.