Java - diseñar una clase que represente una secuencia de ADN

Una cadena de ADN se representa como una secuencia circular de bases (adenina, timina, citosina y guanina) que es única para cada ser vivo, por ejemplo:
A T G
T C
A T G
Dicha cadena se puede representar como un vector de caracteres recorriéndola en sentido horario desde la parte superior izquierda:
A T G C G T A T
Se pide diseñar una clase que represente una secuencia de ADN e incluya un método booleano que nos devuelva true si dos cadenas de ADN coinciden.
MUY IMPORTANTE: La secuencia de ADN es cíclica, por lo que puede comenzar en cualquier posición. Por ejemplo, las dos secuencias siguientes coinciden:
A T G C G T A T
A T A T G C G T
alguien me puede colaborar con este algoritmo

Qué tan larga es la cadena?

• CadenaADNApp.java.zip(563,0 B)

gracias, es programa es una secuencia de 4 caracteres distintos, que se repiten, me piden ingresar una secuencia con estos caracteres y verificar si es compatible o no con otra secuencia ingresada tambien por teclado, lo que pasa es que las cadenas de adn son ciclicas y no siempre comienzan por el mismo lado

me piden que sea con arreglos..

Ya veo, la implementación actual es con strings, habría que cambiarlo a arreglos, avisas si necesitas ayuda, saludos.

si claro, no lo he entendido mucho