Java - duda sobre componentes GUI

Tengo una duda, estoy empesando a ver si logro entender JAVA, que pasa si yo creo un jFrame Principal, con su JDesktopPane, y creo los formularios JInternalFrame dentro de ese mismo formulario principal, y lo unico que hago es ocultarlos y motrarlos mediante un Menu y el metodo .setVisible(true|false), puede darme problemas esto???que estaria haciendo mal???gracias y saludos de antemano.