Temas de Linux - Convertir de ISO-8859-1 a UTF-8

Trabajando en uno de mis proyectos, me vi en la necesidad de hacer una conversión completa del Charset de todos mis archivos y bases de datos de ISO-8859-1 a UTF-8.
Pongamos un ejemplo particular; un proyecto con archivos PHP, HTML y JavaScript en una codificación ISO-8859-1 y una base de datos MySQL con una codificación latin1_spanish_ci. El objetivo es: convertir los archivos del proyecto a UTF-8 y la base de datos a utf8_general_ci.